以下是集裝箱整箱和拼箱流轉的基本程序：

整箱貨流轉程序：

1. 訂艙：貨主向船公司或其代理人或貨運代理人預訂貨艙。

2. 訂艙確認：船公司或其代理人或貨運代理人確認訂艙，簽發裝貨單（場站收據），并將其分送至集裝箱堆場和集裝箱貨運站，據此安排空箱及辦理貨運交接。

3. 發送空箱：整箱貨運所需的空箱由船公司送交或由發貨人到集裝箱碼頭堆場領取。

4. 整箱貨裝箱：由發貨人自行負責裝箱，并將已加海關封志的整箱貨發運至CY（集裝箱堆場）。

5. 集裝箱交接簽證：在CY或CFS進行驗收貨物和/或箱子，即在場站收據上簽字，并將簽署后的D/R交還給發貨人。

6. 換取提單：發貨人憑D/R向集裝箱運輸經營人或其代理換取提單（COMBINED TRANSPORT BILL OF LADING），然后去銀行辦理結匯。

7. 裝船：集裝箱堆場根據船舶積載計劃，進行裝船。

拼箱貨流轉程序：

1. 訂艙：拼箱貨發貨人向集裝箱貨運站或其代理人預訂艙位。

2. 訂艙確認：集裝箱貨運站或其代理人確認訂艙，簽發裝貨單（場站收據），并將其分送至集裝箱堆場和拼箱貨運站，據此安排空箱及辦理貨運交接。

3. 發送空箱：拼箱貨運所需的空箱一般由貨運站領取。

4. 拼箱貨裝箱：發貨人將不足一整箱的貨物交至貨運站，由貨運站根據訂艙清單和場站收據負責裝箱，然后由裝箱人編制集裝箱裝箱單(CONTAINER LOAD PLAN)。

5. 集裝箱交接簽證：在CY或CFS進行驗收貨物和/或箱子，即在場站收據上簽字，并將簽署后的D/R交還給發貨人。

6. 換取提單：發貨人憑D/R向集裝箱運輸經營人或其代理換取提單（COMBINED TRANSPORT BILL OF LADING），然后去銀行辦理結匯。

7. 裝船：集裝箱堆場根據船舶積載計劃，進行裝船。

以上就是集裝箱整箱、拼箱流轉的基本程序，總的來說，集裝箱整箱和拼箱各有其特點和適用情況，需要根據具體情況選擇適合的運輸方式。